解题思路：常考的真核生物：绿藻、衣藻、真菌（如酵母菌、霉菌、蘑菇）、原生动物（如草履虫、变形虫）及动、植物．
常考的原核生物：蓝藻（如颤藻、发菜、念珠藻、蓝球藻）、细菌（如乳酸菌、硝化细菌、大肠杆菌等）、支原体、放线菌．
此外，病毒既不是真核也不是原核生物．
A、草履虫是一种原生动物，属于真核生物；
B、念珠藻是一种蓝藻，属于原核生物；
C、水绵是一种低等植物，属于真核生物；
D、酵母菌是一种真菌，属于真核生物．
由此可见，念珠藻的结构与其他三种生物存在明显差异．
故选：B．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题考查细胞种类，对于此类试题，考查需要掌握一些常考的生物所属的类别，特别是原核生物，包括蓝藻、细菌、支原体、衣原体、放线菌，其中对于细菌的判断，要掌握技巧，一般在菌字前有“杆”、“球”、“螺旋”和“弧”等字样的都为细菌．