解题思路：由配子直接发育的个体称为单倍体；用秋水仙素处理萌发的种子或幼苗得到的不一定是多倍体植株，也可能是二倍体植株；人工种子是指通过植物组织培养得到的胚状体、不定芽、顶芽和腋芽等为材料，通过人工薄膜包装得到的种子．
A、由配子直接发育的个体称为单倍体，花药中的花粉是植物的配子，所以采用花药离体培养得到单倍体植株，故A正确；
B、用秋水仙素处理萌发的种子或幼苗得到的不一定是多倍体植株，如用秋水仙素处理含有一个染色体组的单倍体个体，得到的是二倍体，故B错误；
C、人工种子是指通过植物组织培养得到的胚状体、不定芽、顶芽和腋芽等为材料，通过人工薄膜包装得到的种子，可见该过程需要采用植物组织培养技术，故C正确；
D、运用植物细胞工程的植物体细胞杂交技术可以培育出“番茄-马铃薯”杂种植株，故D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 植物培养的条件及过程．
考点点评： 本题考查植物组织培养及应用、多倍体育种、植物体细胞杂交，意在考查考生的识记能力和理解所学知识要点，把握知识间内在联系，形成知识网络结构的能力；能运用所学知识，准确判断问题的能力．