这主要是固氮根瘤菌的固氮方式有关
自生固氮微生物在土壤或培养基中生活时,可以自行固定空气中的分子态氮,对植物没有依存关系.常见的自生固氮微生物包括以圆褐固氮菌为代表的好氧性自生固氮菌、以梭菌为代表的厌氧性自生固氮菌,以及以鱼腥藻、念珠藻和颤藻为代表的具有异形胞的固氮蓝藻（异形胞内含有固氮酶,可以进行生物固氮）.
共生固氮微生物只有和植物互利共生时,才能固定空气中的分子态氮!(这是重点!)共生固氮微生物可以分为两类：一类是与豆科植物互利共生的根瘤菌,以及与桤木属、杨梅属和沙棘属等非豆科植物共生的弗兰克氏放线菌；另一类是与红萍（又叫做满江红）等水生蕨类植物或罗汉松等裸子植物共生的蓝藻.由蓝藻和某些真菌形成的地衣也属于这一类.