贝加尔湖呈新月形,长636公里,宽24~80公里,面积31,494平方公里,是亚洲第一大淡水湖,也是世界第七大湖泊,属於构造湖,沿岸地震频繁、多温泉,流域面积560,000平方公里,有多达336条河注入,其中仅有一条安加拉河为其外流河,流向北极海,湖中有22岛,最大的奥尔洪岛 (Olkhon island)长达72公里,湖面每年1月至4月结冰.
贝加尔湖是世界最深的湖泊,最深处从原先测量的1620米（5315英尺）,再次测量为1940米（6365英尺）,平均深度758米,湖面海拔456米,最深处湖床海拔—1484米,因深度深,其体积达23,600立方公里,占全球河、湖总水量(包括淡水和咸水)的20%,比整个波罗的海的水量还多,仅次於裏海 (78,200立方公里).贝加尔湖也是世界最古老的湖泊,据研究,它已经在地球上存在超过2,500万年的历史.
贝加尔湖有世界上唯一的淡水海豹贝加尔海豹和贝加尔鲟.