解题思路：1、基因工程中目的基因进入受体细胞，并在其中维持稳定和表达的过程称转化；艾弗里体外转化实验中，S-DNA能进入R型活菌细胞内，并使R型活菌转化为S型活菌的也是此原理．基因工程在本质上属于基因重组，所以细菌转化的实质是发生了基因重组．
2、科学家首先用放射性同位素35S标记了一部分噬菌体的蛋白质，并用放射性同位素32P标记了另一部分噬菌体的DNA，然后，用被标记的T2噬菌体分别去侵染细菌，当噬菌体在细菌体内大量增殖时，生物学家对被标记物质进行测试．测试的结果表明，噬菌体的蛋白质并没有进入细菌内部，而是留在细菌的外部，噬菌体的DNA却进入了细菌体内，彻底将蛋白质和DNA 分开．
3、作为遗传物质应具备的特点是：①分子结构具有相对稳定性；②能自我复制，保持上下代连续性；③能指导蛋白质合成；④能产生可遗传变异．
A、孟德尔实验只是推测遗传因子的存在，并没有揭示出遗传因子的本质，A错误；
B、在肺炎双球菌转化实验中，S型双球菌的DNA重组到R型菌的DNA上，使R型菌转化为S型菌，B正确；
C、噬菌体侵染细菌实验中，噬菌体的蛋白质并没有进入细菌内部，而是留在细菌的外部，噬菌体的DNA却进入了细菌体内，彻底将蛋白质和DNA分开，使实验更有说服力，C正确；
D、最初认为遗传物质是蛋白质，是因为蛋白质稳定、蛋白质的多样性．蛋白质的多样性与氨基酸的种类、数量和排列顺序有关，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 人类对遗传物质的探究历程；肺炎双球菌转化实验；噬菌体侵染细菌实验；孟德尔遗传实验．
考点点评： 本题考查了学生对遗传物质和科学研究方法的理解，加强学生对课本基础知识的牢固掌握和对实验原理的充分理解．