解题思路：基因工程在原则上只能生产自然界已经存在的蛋白质；而蛋白质工程可生产合成自然界中不存在的蛋白质．体细胞融合技术形成的个体具有两个亲本的遗传物质，因此不能用于克隆动物．动物细胞融合技术最重要的用途是制备单克隆抗体．生态工程的原理：（1）物质循环再生原理：物质能在生态系统中循环往复，分层分级利用；（2）物种多样性原理：物种繁多复杂的生态系统具有较高的抵抗力稳定性；（3）协调与平衡原理；（4）整体性原理；（5）系统学和工程学原理．
A、蛋白质工程可合成自然界中不存在的新的蛋白质，A正确；
B、体细胞融合技术可用于制备单克隆抗体，但不能用于克隆动物，B错误；
C、植物细胞培养技术可用于植物茎尖脱毒，动物细胞培养技术可用于转基因动物的培育，C正确；
D、生态工程中，单一的人工林比天然混合林稳定性低，容易遭受害虫危害，体现了物种多样性原理，无无废弃物农业遵循物质循环再生原理，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 蛋白质工程；植物培养的条件及过程；动物体细胞克隆；单克隆抗体的制备过程；生态工程依据的生态学原理．
考点点评： 本题综合考查基因工程、蛋白质工程、细胞工程和生态工程的相关知识，要求考生识记蛋白质工程的概念，并注意与基因工程进行区分；能掌握细胞工程技术及应用，明确培育克隆动物的关键技术是核移植技术；识记生态工程的原理．