解题思路：根据题意分析可知：多肽水解得到的几种氨基酸分子中均只含有一个N原子，因此根据分子式（C21HxOyN4S2）中的N原子数量可知，该多肽由4个氨基酸组成；根据S原子的数目可知，组成该多肽的四个氨基酸中有2个半胱氨酸；再根据C原子的数目可知，组成该多肽的另外两个氨基酸为苯丙氨酸（C9H11NO2）和亮氨酸（C6H13NO2）．
A、由以上分析可知，该多肽水解后形成3种氨基酸，即半胱氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸，A正确；
B、该多肽在核糖体上形成，由4个氨基酸脱水缩合形成的，所以形成过程中相对分子质量减少了18×3=54，B正确；
C、该多肽是由2个半胱氨酸、1个亮氨酸和1个苯丙氨酸组成，因此其分子式为2C3H7NO2S+C9H11NO2+C6H13NO2-3H2O=C21H32O5N4S2，因此该多肽中氢原子数和氧原子数分别为32和5，C错误；
D、该多肽是由4个氨基酸脱水缩合形成的，含有3个肽键，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合．
考点点评： 本题结合多肽的分子式及几种氨基酸的分子式，考查蛋白质的合成--氨基酸脱水缩合，要求考生掌握氨基酸脱水缩合的过程，能根据多肽和几种氨基酸的分子式推断合成该多肽的氨基酸种类及数目，再准确判断各选项，属于考纲理解和应用层次的考查．