楼上3个回答都是概念错误.
1.首先,要弄清楚非编码区,编码区和转录的关系.一般的mRNA被转录,不论是成熟的,还是被剪切完成后的,都含有非编码区,一般称作为5‘UTR和3’UTR,就是在5‘端和3’端的非翻译区（untranslated region).所谓的编码区,也就是要被翻译为蛋白质的区域.
2.启动子是在转录区的上游,也就是肯定是在非编码区了.
3,转录因子先识别,结合到启动子,然后再有RNA转录酶结合过来,开始转录.先合成5‘UTR,然后到编码区,最后是3’UTR.当然,有些中间还有内含子.