解题思路：波源与接收者相互靠近会使接受者接受到的频率增大，但波源的发射频率不变；卢瑟福根据α粒子散射提出了原子核的结构；汤姆生发现的β射线为核外电子流；比结合能越大，表示原子核中核子结合得越牢，原子核越稳定．
A、根据多普勒效应，波源与接收者相互靠近会使接受者接受到的频率增大，但波源的发射频率不变．故A错误；
B、卢瑟福根据α粒子散射提出了原子核的结构，而不是实验证实了原子核的结构．故B错误；
C、汤姆生发现的β射线为核外电子流．故C错误；
D、原子核中，核子的比结合能越大，表示原子核中核子结合得越牢，原子核越稳定．故D正确．
故选：D
点评：
本题考点： 多普勒效应；粒子散射实验；原子核的结合能．
考点点评： 该题考查到3-4中的多普勒效应与3-5中的原子物理的部分知识，都是一些记忆性的知识，对这部分的知识要牢记，避免失分．