A、生活污水集中处理后排放,可以保护水资源,所以做法合理;
B、适量的施用化肥,可以提高农作物产量,所以做法合理;
C、废弃塑料集中焚烧会生成大量的空气污染物,所以做法不合理;
D、重金属会污染土壤和水,所以做法合理.
故选:C.