SCOP将PDB数据库中的蛋白质按传统分类方法分成α型、β型、α/β型、α+β型,并将多结构域蛋白、膜蛋白和细胞表面蛋白、N蛋白单独分类,一共分成7种类型,并在此基础上,按折叠类型、超家族、家族三个层次逐级分类.对于具有不同种属来源的同源蛋白家族,SCOP数据库按照种属名称将它们分成若干子类,一直到蛋白质分子的亚基
SCOP将PDB数据库中的蛋白质按传统分类方法分成α型、β型、α/β型、α+β型,并将多结构域蛋白、膜蛋白和细胞表面蛋白、N蛋白单独分类,一共分成7种类型,并在此基础上,按折叠类型、超家族、家族三个层次逐级分类.对于具有不同种属来源的同源蛋白家族,SCOP数据库按照种属名称将它们分成若干子类,一直到蛋白质分子的亚基