解题思路：（1）从两者的分子结构不同分析判断； （2）主要从碳原子排列的不同分析判断；
（1）水是由水分子构成，而双氧水则有双氧水分子构成，两者的分子结构不同，一个水分子比一个双氧水分子少一个氧原子，所以两者的性质不同；
（2）从碳原子构成单质的结构分析可知：金刚石与石墨的碳原子排列同所以其物理性质有较大差异；
故答案为：（1）二者的分子结构不同；（2）碳原子的排列方式不同；
点评：
本题考点： 利用分子与原子的性质分析和解决问题．
考点点评： 本题考查的是学生对于物质的结构和性质的掌握情况，要明白这个关系“物质的结构决定物质的性质，物质的性质决定物质的用途”，然后对于具体的问题根据所学知识来解决．