解题思路：本题是对组成蛋白质的氨基酸的特点和结构简式及氨基酸脱水缩合反应的考查，回忆组成蛋白质的氨基酸的特点和结构简式及氨基酸脱水缩合反应过程，然后结合题干信息进行解答．
组成蛋白质的氨基酸的结构简式是C2H4O2NR，因此分子式为C42H65N11O9的多肽从N原子分析至多含有含有11个氨基酸，由于三种氨基酸都只含有1个羧基，即2个O原子，因此肽链中氧原子的个数为氨基酸个数加1，从O原子分析，该肽链中含有8个氨基酸，即该多肽链是8肽．
故选：D．
点评：
本题考点： 蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合．
考点点评： 对于组成蛋白质的氨基酸的结构简式的记忆和氨基酸脱水缩合反应过程的理解应用并把握知识点间的内在联系是解题的关键．