解题思路：本题涉及了多个考点，解题关键是识图．图1中考生要能够判断该病为常染色体隐性遗传病，继而判断基因型；图2中看出，A基因突变后，突变位置减少了一个酶切位点．
（1）图1是一个常染色体遗传病，由图可知该病为常染色体隐性遗传病，因此Ⅰ1、Ⅰ2均为Aa，所以Ⅱ2的基因型是AA、Aa．
（2）Ⅱ2的基因型是[1/3]AA、[2/3]Aa；一个处于平衡状态的群体中a基因的频率为q，正常男性为Aa的概率为[Aa/AA+Aa＝
2(1−q)q
(1−q)(1−q)+2(1−q)q＝
2q
1+q]，则他们第一个孩子患病的概率为[2/3×
2q
1+q×
1
4＝
q
3(1+q)]．如果第一个孩子是患者，则Ⅱ2与正常男性的基因型均为Aa，他们第二个孩子正常的概率为[3/4]．
（3）由于不同地区基因突变频率因环境的差异而不同，不同的环境条件下，选择作用会有所不同，因此Aa在不同地区频率不同．
（4）根据杂交结果可知，基因AaBb个体只产生Ab、aB两种类型配子，不符合自由组合定律，因此这两对可能位于同一对同源染色体上．
（5）基因工程中限制酶的作用是识别双链DNA分子的特定核苷酸序列，并切割DNA双链．
（6）由图3可知，1.4kb为a基因片段，1.2kb为A基因片段，所以探针与A基因结合的位置位于酶切位点①与②之间．
故答案为：
（1）AA或Aa
（2）[q
3(1+q)
3/4]
（3）不同地区基因突变频率因环境的差异而不同不同的环境条件下，选择作用会有所不同
（4）同源基因AaBb个体只产生Ab、aB两种类型配子，不符合自由组合定律
（5）特定核苷酸序列
（6）酶切位点①与②之间．
点评：
本题考点： 常见的人类遗传病；基因频率的变化；基因工程的原理及技术．
考点点评： 本题考查了基因的分离定律、自由组合定律、基因频率以及限制酶等相关知识，具有一定的综合性，意在考查考生对知识点的理解和对信息提取分析应用能力，难度适中．