解题思路：本题主要考查了现代生物进化理论的内容．
种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在这个过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
A、地理隔离会导致种群基因库间的差异，但不一定导致生殖隔离，A错误；
B、自然选择是指自然环境对个体进行选择，保留种群的有利基因，新基因是由基因突变产生的，B正确；
C、生物进化的实质是基因频率的改变，生殖隔离是新物种形成的标志，C正确；
D、由题意可知，该种群中的BB=81%，Bb=18%，bb=1%，则B的基因频率是：81%+[1/2]×18%=90%，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 现代生物进化理论的主要内容；基因频率的变化．
考点点评： 现代生物进化理论的主要内容是学习的重点知识．本题主要考查学生对知识的记忆和理解能力．要注意辨析，种群基因频率改变意味着生物进化了，但不一定产生新的物种．新物种的产生必须要经过生殖隔离．