解题思路：保护生物多样性的根本措施是保护生物的栖息地和保护生态系统的多样性．
保护生物多样性首先要保护生物的栖息环境，生物的栖息环境是生物赖以生存的基础，保护了生物的栖息环境，即保护了环境中的生物，环境与生物是一个统一的整体，二者构成生态系统，因此保护生物的栖息环境，就是保护生态系统的多样性．保护生物的栖息环境，保护生态系统的多样性是保护生物多样性的根本措施．最有效的措施是建立自然保护区．C正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 保护生物多样性的基本措施．
考点点评： 明确保护生物的栖息环境，保护生态系统的多样性是保护生物多样的根本措施，这部分内容是考试的重点，注意灵活解答．