质粒上的抗性基因是用来扩繁细菌质粒用的.而基因工程里所说的标记基因还包括植物抗性标记基因,它位于农杆菌双元载体的LB和RB之间,而LB和RB是质粒与染色体重组的两个位点,所以LB和RB之间的基因如抗性基因和与其串联的目的基因就能够整合到植物染色体中,这样,目的基因和抗性基因整合进入一个细胞,随着细胞的分裂,获得转基因植株.
当然,并不能保证有标记基因就有目的基因,因为染色体还存在重组,有可能在重组的过程中会把目的基因和抗性基因分开.这也是目前人们制作markerfree转基因植株的目的.但这个发生的概率很低.
人们通过PCR检测目的基因同时检测抗性基因,就获得了同时含有目的基因和抗性基因的植株.
标记基因的目的是为了便于人们做遗传转化筛选阳性植株.当然,你也可以不加标记基因去做筛选,只是工作量非常非常大了.