解题思路：生物多样性包括物种多样性、遗传多样性和生态系统多样性．其中遗传多样性是生物多样性的实质．
生物多样性通常有三个主要的内涵，即生物种类的多样性、基因（遗传）的多样性和生态系统的多样性．生物种类的多样性是指一定区域内生物钟类（包括动物、植物、微生物）的丰富性．不同物种之间基因组成差别很大，生物的性状是由基因决定的，生物的性状千差万别，表明组成生物的基因也成千上万，同种生物之间的基因也有差别，每个物种都是一个独特的基因库．基因的多样性决定了生物种类的多样性．因此生物种类的多样性实质上是基因（遗传）的多样性．可见A正确．
故选：A
点评：
本题考点： 生物的多样性的内涵．
考点点评： 解答此类题目的关键是理解生物多样性的内涵，明确生物多样性的实质是基因的多样性．