解题思路：A、物质由原子、分子或离子构成，并不是都由分子构成；
B、水分子是保持水的化学性质的最小粒子，说法正确；
C、分子在化学变化中可以再分，原子在化学变化中不可以再分；
D、原子核是由质子和中子构成的．
A、物质都是由分子构成的，说法错误，有些物质由原子或离子构成，故A错误；
B、水分子是保持水的化学性质的最小粒子，说法正确，故B正确；
C、原子在化学变化中可以再分，说法错误，原子在化学变化中不可以再分，故C错误；
D、原子核是由质子和电子构成的，说法错误，原子核是由质子和中子构成的，故D错误．
故选B．
点评：
本题考点： 分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；原子的定义与构成；分子和原子的区别和联系；分子的定义与分子的特性．
考点点评： 了解分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；分子是保持物质化学性质的微粒；原子是化学变化中最小的微粒；
带电的原子或原子团称为离子．