（1）装运A种物资的车辆数为x，装运B种物资的车辆数为y，则装运C种物资的车辆数为（20-x-y），
根据题意得，12x+10y+8（20-x-y）=200，
整理得，y=20-2x；
（2）当y=20-2x时，20-x-y=x，
则装运A、B、C三种化学物资的车辆数分别为x，20-2x，x，
由题意，得
x≥5
20-2x≥4 ，
解这个不等式组，得5≤x≤8，
因为x为整数，所以x的值为5，6，7，8．
所以安排方案有4种：
方案一：装运A种物资5辆、B种物资10辆、C种物资5辆；
方案二：装运A种物资6辆、B种物资8辆、C种物资6辆；
方案三：装运A种物资7辆、B种物资6辆、C种物资7辆；
方案四：装运A种物资8辆、B种物资4辆、C种物资8辆；
（3）设总运费为W元，
则W=12×240x+10×320（20-2x）+8×200x，
即：W=-1920x+64000，
∵W是x的一次函数，且W随x的增大而减小，
∴当x=8时，W最小，最少为48640元．