解题思路：核糖体普遍分布于原核生物和真核生物的细胞中，是分布最广泛的细胞器，但病毒不含核糖体；核糖体主要由蛋白质和RNA（组成元素C、H、O、N、P）组成；核糖体是合成蛋白质的场所；核糖体的形成与核仁有关．
A、病毒没有细胞结构，不含核糖体，A错误；
B、核糖体主要由蛋白质和RNA组成，而RNA的组成元素为C、H、O、N、P，所有核糖体含有磷元素，B错误；
C、核糖体是氨基酸脱水缩合形成蛋白质的场所，因此能产生水，但不能形成ATP，C错误；
D、核仁与某些RNA的合成和核糖体的形成有关，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 细胞器中其他器官的主要功能；细胞核的结构和功能．
考点点评： 本题考查细胞结构和功能、组成细胞的元素和化合物等相关知识，重点考查核糖体的相关内容，要求考生识记核糖体的分布、组成成分、功能及形成，能运用所学的知识对选项作出准确的判断．本题的易错点是A选项，要求考生明确核糖体是分布最广泛的细胞器，但不是所有的生物都含有．