解题思路：本题主要考查染色体、DNA和基因的关系．遗传物质在细胞中的结构层次（由小到大）：基因→DNA分子→染色体→细胞核→细胞．
A、基因主要存在于细胞核的染色体上，染色体是基因的主要载体，A错误；
B、基因是基因遗传效应的DNA片段，其组成的基本单位是脱氧核苷酸，B错误；
C、基因是基因遗传效应的DNA片段，是DNA的基本结构和功能单位，C正确；
D、基因突变指的是DNA分子中碱基对的增添、缺失或改变，而基因的数目不会发生改变，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因与DNA的关系．
考点点评： 本题考查基因与DNA的关系，要求考生识记基因的概念，明确基因是有遗传效应的DNA片段；一个DNA分子中有多个基因，试题难度中等．