解题思路：变异包括可遗传变异和不可遗传变异，前者是由于遗传物质改变引起的，后者是环境因素引起的．
基因突变是基因结构的改变，包括碱基对的增添、缺失或替换．
基因重组是指同源染色体上非姐妹单体之间的交叉互换和非同源染色体上非等位基因之间的自由组合．
染色体变异是指染色体结构和数目的改变．染色体结构的变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种类型．染色体数目变异可以分为两类：一类是细胞内个别染色体的增加或减少，另一类是细胞内染色体数目以染色体组的形式成倍地增加或减少．
摩尔根培养红眼果蝇进行遗传实验，培养若干代后，偶然发现了一只白眼雄果蝇，说明这些红眼果蝇是纯种，不可能重组出白眼性状，而染色体变异产生的改变幅度较大，所以该变异应该是基因突变，红眼基因突变为白眼基因所致．
故选：A．
点评：
本题考点： 基因突变的特征．
考点点评： 本题考查基因突变的特征的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．