解题思路：本题是对遗传信息的表达、植物的光合作用过程、细胞有氧呼吸过程和蛋白质的结构的综合性考查，梳理遗传信息表达过程和发生的场所、光合作用和有氧呼吸的具体过程及蛋白质的基本组成单位的特点，然后根据选项涉及的具体内容分析综合进行判断．
A、尿嘧啶核糖核苷酸是RNA合成的原料，RNA的合成是DNA的转录过程，基因表达形成蛋白质包含转录和翻译过程，洋葱根尖细胞蛋白质的合成不仅仅发生在分生区细胞中，所以让洋葱根尖吸收含3H标记的尿嘧啶核糖核苷酸，放射性不仅仅分布在分生区细胞中，A错误；
B、CO2是植物光合作用的原料，给小麦供应14CO2，通过光合作用形成含有14C葡萄糖，含有14C葡萄糖经过糖酵解形成含有14C的丙酮酸，进入线粒体中进行有氧呼吸的第二、第三阶段，因此14C会出现在线粒体中，B错误；
C、氧气参与有氧呼吸的第三阶段生成水，给豚鼠供应18O2，首先生成含有18O的水，含有18O的水可以参与有氧呼吸的第二阶段，与丙酮酸反应生成含有18O的二氧化碳，因此呼出气体中可能含有C18O2，C错误；
D、根据氨基酸的结构简式是C2H4O2NR，氨基酸的元素组成是C、H、O、N，若存在其他元素，则在R基中，因此，若用35S标记噬菌体的蛋白质时，标记元素在氨基酸的R基中，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 氨基酸的分子结构特点和通式；光反应、暗反应过程的能量变化和物质变化；有氧呼吸的过程和意义；遗传信息的转录和翻译．
考点点评： 本题的知识点是发生转录过程的细胞，植物细胞中光合作用和呼吸作用的关系及在这两个过程中C元素的转移途径，有氧呼吸过程中氧元素的转移途径，组成蛋白质的氨基酸的结构简式的特点，对于相关知识点的理解掌握和综合应用是解题的关键．