要形成对照实验的前提必须有惟一变量，而1号瓶满足种子萌发的外界条件，所以1号瓶能萌发，作对照组，而实验组要与他形成对照．而2号瓶由于加较多的水浸没种子是种子无法得到足够的氧气，3号瓶缺少水分，4号瓶温度较低．都没有满足种子萌发的外界条件故不能萌发．所以2、3、4只能作为实验组．而2、3、4都与1有唯一变量，所以可以形成3组对照实验，即1和3（证明种子萌发需要适量的水分）；1和2（证明种子萌发需要充足的空气）；1和4（证明种子的萌发需要适宜的温度）．所以，“为证明水分对种子萌发的影响作用”可选1号和3号进行对照
故选：C