解题思路：A、矿泉水中含有水和溶于水的矿物质，属于混合物；
B、一氧化碳有毒，二氧化碳无毒；
C、普通氢原子中不含有中子；
D、同种元素的原子、离子中含有相同的质子数．
A、生活中“娃哈哈”、“农夫山泉”“康师傅”等矿泉水都属于混合物．故选项错误；
B、室内CO2和CO含量过高时都会造成人的死亡，因为一氧化碳有毒，二氧化碳不能供给呼吸．故选项错误；
C、普通氢原子的原子核中不含有中子．故选项错误；
D、在Fe、Fe2+、Fe3+三种微粒的原子核内，它们的质子数都是相同的．故选项正确．
故选D．
点评：
本题考点： 纯净物和混合物的判别；原子的定义与构成；原子结构示意图与离子结构示意图．
考点点评： 本题主要考查物质的分类、性质和微观粒子的特征等方面的知识，解答时要理解发生化学变化时，核外电子发生转移，核内质子数不变．