解题思路：根据题意分析可知：三对基因独立遗传，符合基因自由组合规律．由于基因A、C、R对种子有色缺一不可，所以有色植株的基因型中必定含有ACR，根据其与另三株纯合个体杂交的后代有色种子的比例，即可推测出其基因型．
设有色植株为M，则其基因型为A-C-R-，由于三株个体基因型不同，但都具有二对基因隐性纯合和一对基因显性纯合．假设M为显性纯合体，则后代都为有色种子；假设M中有一对是显性纯合，则：①显性纯合基因与杂交个体的一对基因显性纯合相同，后代有色种子的比例为25%；显性纯合基因与杂交个体的一对基因显性纯合不相同，后代有色种子的比例为50%；假设M中没有一对是显性纯合即完全杂合，则后代有色种子的比例均为25%，没有50%．所以该有色植株的基因型不可能是显性纯合体或完全杂合体．
故选D．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因自由组合规律的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．