真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因.但实际上,人细胞中所含基因总数大概会超过10万个.这就说明在人细胞基因组中有许多DNA序列并不转录成mRNA用于指导蛋白质的合成.DNA的复性动力学研究发现这些非编码区往往都是一些大量的重复序列,这些重复序列或集中成簇,或分散在基因之间.在基因内部也有许多能转录但不翻译的间隔序列（内含子）.因此,在人细胞的整个基因组当中只有很少一部份（约占2-3％）的DNA序列用以编码蛋白质.
【特点】
1.真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体,储存于细胞核内,除配子细胞外,体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体,diploid）,即有两份同源的基因组.
2.真核细胞基因转录产物为单顺反子.一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链.
3.存在重复序列,重复次数可达百万次以上.
4.基因组中不编码的区域多于编码区域.
5.大部分基因含有内含子,因此,基因是不连续的.
6.基因组远远大于原核生物的基因组,具有许多复制起点,而每个复制子的长度较小.