基因预测共有两种方法,一是通过denovo的方法,根据基因的一些结构特征,如剪切位点的碱基和编码区与非编码区的GC偏向不同等.另一种是通过和近缘物种进行比较,因为近缘物种间的基因结构相似,所以如果两个序列的相似性很高,那么他们也许就有相同的功能.