最近刚学完这部分.其实忽略工程实际中的问题,即考虑线路为变压器为理想变压器,无励磁损耗,电流互感器为理想变压器（理想变流器）,无励磁损耗等理想情况,两种纵差保护其实方法相同,要考虑的问题也相同（只不过变压器两侧电压电流不同,但折合以后两侧就完全相同了,这样与线路纵差保护没有区别）.
但是工程中,会考虑以下问题
（1）变压器的励磁电流（尤其是在异步电机自启动时,励磁电流很大）
（2）电流互感器的励磁电流
（3）变压器带负荷调压（即改变变比）,而电流互感器的变比无法改变
（4）电流互感器变比不标准（即做设计时考虑的变比与最后安装时候的变比有出入）
以上是主要原因,还有一些其他原因请参见《电力系统继电保护》天大版
不知道对你有否帮助?