We have two spare rooms downstairs,but nether of them has been used for more than two months.
这不是一个定语从句,而是并列句,和and连接的两个句子的用法相似,不过此处用的是表转折的并列连词“but”.and或者but连接两个句子时,中间逗号有时有有时无,通常如果前后两个句子的结构一致（比如时态一致,动词类型一致等）,而且句子又比较短时通常不加逗号,但前后两个句子结构不一致,句子又比较长时,通常要加上逗号.
我们楼下有两个空房间,不过这两间房子都使用不足两个月.