解题思路：此题是一道实验分析题，用到的知识有光合作用、蒸腾作用、茎的输导作用、氢氧化钠吸收二氧化碳的原理等知识．涉及到的知识点比较多，考查的知识面比较广．
（1）茎中的输导组织有木质部中的导管和韧皮部中的筛管，木质部中的导管是运输水分和无机盐的，韧皮部中的筛管是运输有机物的，因为水分的运输是通过木质部中的导管，故被染红的应该是木质部．
（2）水分以气体状态通过叶片表皮上的气孔从植物体内散失到植物体外的过程叫做蒸腾作用；傍晚，广口瓶内液面下降了不少，这是植物通过蒸腾作用散失水分的缘故．
（3）把叶片d放到盛有氢氧化钠溶液的瓶子中，由于氢氧化钠溶液有吸收空气中的二氧化碳的作用，这样d与a、b、c的区别是它的周围没有了二氧化碳，所以惟一的变量是二氧化碳，故该实验探究的是二氧化碳在光合作用中的作用．设计对照实验时唯一变量是二氧化碳，所以准备另一套实验装置但用清水代替浓氢氧化钠溶液．
故答案为：（1）木质部 （2）蒸腾作用 （3）二氧化碳；准备另一套实验装置，但用清水代替浓氢氧化钠溶液
点评：
本题考点： 探究茎对水分和无机盐的运输；探究光合作用的条件、原料和产物；探究植物的蒸腾作用．
考点点评： 光合作用表达式：