解题思路：分析实验装置可知：该同学设计的实验中有三组对照实验：②与①、②与③、②与⑤，变量分别是水分、空气、温度．
（1）②种子满足了种子萌发的环境条件，如果自身条件适宜，则②号种子能够萌发；种子萌发的条件有自身条件和环境条件；自身条件是指种子的胚是完整的、活的，并且已过休眠期，环境条件是指适宜的温度、充足的空气和充足的水分；②号种子在满足了环境条件的情况下仍然没有萌发，说明该粒种子的胚不完整或种子已经死亡或种子正处在休眠期．
（2）由于探究实验变量的惟一性，该实验方案中实际上包括三组对照实验，其中②与⑤对照组有唯一变量--温度，主要探究的是温度对种子萌发的影响；②与①对照组有唯一变量--水分，主要探究的是水分对种子萌发的影响；与⑤对照组有唯一变量--空气，主要探究的是空气对种子萌发的影响．
故答案为：（1）2；种子自身可能有问题
（2）种子萌发是否受空气影响；种子萌发是否需要一定的水分
点评：
本题考点： 探究种子萌发的条件．
考点点评： 掌握探究实验变量的惟一性，在探究种子萌发的外界条件时要关注种子萌发的自身条件及休眠期的问题．