解题思路：S1球做的是平抛运动，解决平抛运动的方法是把平抛运动分解到水平方向和竖直方向去研究，水平方向做匀速直线运动，竖直方向做自由落体运动．
S2球做的是斜抛运动，它在水平方向上也是匀速直线运动，但在竖直方向上是竖直上抛运动．
A、由于两球恰在M、N连线的中点正上方相遇，说明它们的水平位移大小相等，又由于运动的时间相同，所以它们在水平方向上的速度相同，即v2cosθ=v1，所以v2＞v1，故A错误．
B、由于两个球都只受到重力的作用，加速度都是重力加速度，由△v=at=gt，知它们速度的变化量相同，故B正确．
C、在水平方向上，它们的运动方向相反，位移的方向也相反，位移是矢量，所以位移不会相等，故C错误．
D、由于两个球都只受到重力的作用，加速度都是重力加速度，加速度恒定，是匀变速运动，故D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 平抛运动．
考点点评： 平抛运动和斜抛运动在水平方向都是匀速直线运动，不同的是在竖直方向上的运动，但在竖直方向上的加速度是一样的，都是重力加速度．