解题思路：现代生物进化理论的基本观点：种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质在于种群基因频率的改；突变和基因重组产生生物进化的原材料；自然选择使种群的基因频率发生定向的改变并决定生物进化的方向；隔离是新物种形成的必要条件．
A、生物多样性的内容包括：基因的多样性、物种的多样性和生态系统的多样性；故生物多样性的形成不一定有新物种的产生，A错误；
B、自然界中由于存在着自然选择故种群的基因频率一定会发生变化，B正确；
C、种群是生物进化的基本单位，C错误；
D、地理隔离能使种群基因库产生差别，但不一定导致生殖隔离，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 现代生物进化理论的主要内容．
考点点评： 本题知识点简单，考查现代生物进化理论的主要内容、生物多样性，要求考生识记现代生物进化理论的主要内容，识记生物多样性形成的原因，能运用所学的知识准确判断各选项，属于考纲识记层次的考查．