解题思路：种群度调查除了样方法之外还有标志重捕法、取样器取样调查法．探究酵母菌种群数量变化用血球计数板进行抽样检测计数．
A、研究鼠等动物的种群密度时，由于动物的运动范围大，所以要用标志重捕法调查，而不应用样方法，A错误；
B、采用标志重捕法调查鼠等动物的种群密度时，应防止标志物脱落；调查土壤动物的丰富度时，应用取样器取样，B错误；
C、用血球计数板计数酵母菌数量时，应统计方格内和两条邻边线的个体，C错误；
D、用取样器取样法调查土壤小动物丰富度时，可以用目测估计法统计各种群的数量，D正确．
故选D．
点评：
本题考点： 土壤中动物类群丰富度的研究；估算种群密度的方法．
考点点评： 本题考查种群密度的调查、酵母菌数量统计和物种丰富度调查的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．