生物分类的依据主要是生物在形态结构等方面的特征．（1）衣藻和叶肉细胞的细胞内都有叶绿体，能进行光合作用自己制造有机物，而细菌、酵母菌、草履虫、口腔上皮细胞没有，因此，将衣藻和叶肉细胞归为B类．病毒没有细胞结构，衣藻、叶肉细胞、细菌、酵母菌、草履虫、口腔上皮细胞6项都具有细胞结构，故把除病毒以外的其它6项归为C类．
（2）衣藻、草履虫、叶肉细胞、酵母菌和人体口腔上皮细胞都具有真正的细胞核，而细菌没有成形的细胞核，只有DNA集中的区域（病毒没有细胞结构），因此，可以把衣藻、草履虫、叶肉细胞、酵母菌和人体口腔上皮细胞归为D类．
故答案为：
（1）都具有叶绿体，能自己制造有机物；病毒没有细胞结构，其他6项都具有细胞结构；
（2）
（依据是）衣藻、草履虫、叶肉细胞、酵母菌和人体口腔上皮细胞都具有真正的细胞核，细菌则没有．