太阳系于何处结束,以及星际介质开始的位置没有明确定义的界线,因为这需要由太阳风和太阳引力两者来决定.太阳风能影响到星际介质的距离大约是冥王星距离的四倍,但是太阳的洛希球,也就是太阳引力所能及的范围,应该是这个距离的千倍以上.
日球层顶
太阳圈可以分为两个区域,太阳风传递的最大距离大约在95 天文单位,也就是冥王星轨道的三倍之处.此处是终端震波的边缘,也就是太阳风和星际介质相互碰撞与冲激之处.太阳风在此处减速、凝聚并且变得更加纷乱,形成一个巨大的卵形结构,也就是所谓的日鞘,外观和表现得像是彗尾,在朝向恒星风的方向向外继续延伸约40 天文单位,但是反方向的尾端则延伸数倍于此距离.太阳圈的外缘是日球层顶,此处是太阳风最后的终止之处,外面即是恒星际空间.
太阳圈外缘的形状和形式很可能受到与星际物质相互作用的流体动力学的影响,同时也受到在南端占优势的太阳磁场的影响；例如,它形状在北半球比南半球多扩展了9个天文单位（大约15亿公里）.在日球层顶之外,在大约230天文单位处,存在着弓激波,它是当太阳在银河系中穿行时产生的.
还没有太空船飞越到日球层顶之外,所以还不能确知星际空间的环境条件.而太阳圈如何保护在宇宙射线下的太阳系,目前所知甚少.为此,人们已经开始提出能够飞越太阳圈的任务.
奥尔特云（Oort Cloud）
是一个假设包围着太阳系的球体云团,布满着不少不活跃的彗星,距离太阳约50,000至100,000个天文单位,差不多等于一光年,即太阳与比邻星（Proxima）距离的四分一. 理论上的奥尔特云有数以兆计的冰冷天体和巨大的质量,在大约5,000 天文单位,最远可达10,000天文单位的距离上包围着太阳系,被认为是长周期彗星的来源.它们被认为是经由外行星的引力作用从内太阳系被抛至该处的彗星.奥尔特云的物体运动得非常缓慢,并且可以受到一些不常见的情况的影响,像是碰撞、或是经过天体的引力作用、或是星系潮汐.
塞德娜和内奥尔特云
塞德娜(Sedna)是颗巨大、红化的类冥天体,近日点在76 天文单位,远日点在928 天文单位,12,050年才能完成一周的巨大、高椭率的轨道.米高·布朗在2003年发现这个天体,因为它的近日点太遥远,以致不可能受到海王星迁徙的影响,所以认为它不是离散盘或柯伊伯带的成员.他和其他的天文学家认为它属于一个新的分类,同属于这新族群的还有近日点在45 天文单位,远日点在415 天文单位,轨道周期3,420年的2000 CR105,和近日点在21 天文单位,远日点在1,000 天文单位,轨道周期12,705年的(87269) 2000 OO67.布朗命名这个族群为"内奥尔特云",虽然它远离太阳但仍较近,可能是经由相似的过程形成的.塞德娜的形状已经被确认,非常像一颗矮行星.
疆界
我们的太阳系仍然有许多未知数.考量邻近的恒星,估计太阳的引力可以控制2光年（125,000天文单位）的范围.奥尔特云向外延伸的程度,大概不会超过50,000天文单位.尽管发现的塞德娜,范围在柯伊伯带和奥尔特云之间,仍然有数万天文单位半径的区域是未曾被探测的.水星和太阳之间的区域也仍在持续的研究中.在太阳系的未知地区仍可能有所发现.