解题思路：基因工程的基本操作步骤主要包括四步：①目的基因的获取；②基因表达载体的构建；③将目的基因导入受体细胞；④目的基因的检测与鉴定．基因工程的工具有：限制性核酸内切酶、DNA连接酶和运载体．基因表达载体的组成包括：目的基因、启动子、终止子、标记基因．标记基因的作用是为了鉴定受体细胞中是否含有目的基因，从而将含有目的基因的细胞筛选出来．常用的标记基因是抗生素基因．
A、图示过程为基因表达载体的构建，属于基因工程的核心步骤，A正确；
B、根据图示可知，使用限制酶SmaⅠ会破坏目的基因（抗原基因），B错误；
C、抗卡那霉素基因是标记基因，其作用是将含有抗原基因的细胞筛选出来，C正确；
D、基因表达载体的组成包括：目的基因、启动子、终止子、标记基因，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 基因工程的原理及技术．
考点点评： 本题结合基因表达载体的构建过程图，考查基因工程的相关知识，意在考查考生能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或的能力．