解题思路：双链DNA分子具有规则的双螺旋结构；密码子有64种，但有3种是终止密码子，不编码氨基酸；生物进化的实质是种群基因频率的定向改变；生物体的性状是基因和环境共同决定的；细胞类生物的遗传物质都是DNA，病毒的遗传物质是DNA或RNA．
①双链DNA分子都具有双螺旋结构，①正确；
②有3种终止密码子不编码氨基酸，所以tRNA中的反密码子共有61种，②错误；
③自然选择能使种群基因频率发生定向改变，这也是生物进化的实质，③正确；
④生物体的性状除了受基因控制外，还受环境因素的影响，④错误；
⑤多倍体育种和单倍体育种都需要秋水仙素，⑤错误；
⑥原核生物含有DNA和RNA，但其遗传物质是DNA，⑥正确．
故选：D．
点评：
本题考点： DNA分子结构的主要特点；RNA分子的组成和种类；基因与性状的关系；自然选择学说的要点．
考点点评： 本题综合考查DNA分子结构特点、遗传信息的转录和翻译、生物进化、基因与性状的关系、育种和原核生物等内容，涉及知识范围较广，要求考生掌握的知识点较多，属于考纲识记和理解层次的考查．本题需要注意的是②，要求考生注意密码子有64种，但有3种是终止密码子，不编码氨基酸，没有对应的反密码子．