解题思路：根据分子、原子的定义、四种基本反应类型及氧化物、化合物的定义解答；基本反应类型的特点：置换反应单换单，复分解反应成分两交换、化合价不变；氧化物必须是由两种元素组成；化合物属于纯净物．
①分子是保持物质化学性质的一种微粒，不能保持物理性质，故①错；②原子是化学变化中的最小微粒，在化学变化中不能再分，在结构上还可以分成原子核和核外电子，故②错；③置换反应是一种单质和一种化合物反应生成另一种单质和另一种化合物的反应；有单质生成的反应不一定是化合反应，如一氧化碳还原氧化铁生成铁和二氧化碳，3CO+Fe2O3高温 2Fe+3CO2不属于基本反应类型，故③错；④复分解反应是两种化合物相互交换成分生成另外两种化合物的反应，生成两种化合物的反应不一定是复分解反应，如2NaOH+CO2═Na2CO3+H2O不属于复分解反应；故④错；
⑤氧化物是指由两种元素组成，其中一种是氧元素的化合物，含有氧元素的化合物不一定是氧化物，如K2CO3不是氧化物，故⑤错；⑥化合物是由不同种元素组成的纯净物，故⑥正确；
故选C
点评：
本题考点： 分子的定义与分子的特性；从组成上识别氧化物；单质和化合物的概念；原子的定义与构成；置换反应及其应用；复分解反应及其应用．
考点点评： 记住分子、原子、氧化物、化合物及四种基本反应类型的概念，理解其内涵与外延是解答本题关健．