解题思路：种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在这个过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
A、长期生活在黑暗环境下的盲鱼的眼睛退化是由于自然选择作用，会导致基因频率的改变，也是种进化，A正确；
B、种群较大时，突变个体与其他个体交配几率较大，遗传给后代的几率大，所以从种群的个体数量角度看，突变在较大的种群中比在较小的种群中容易保存，B正确；
C、对生物体有害的隐性基因在纯合状态下会表达该有害性状，导致其在自然选择过程中被淘汰，而在杂合状态下，该基因不会表达有害性状，不容易在自然选择过程中被淘汰，C正确；
D、新物种的形成必需经过隔离，生殖隔离是新物种形成的标志，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 生物进化与生物多样性的形成．
考点点评： 本题考查变异和生物进化的相关知识，意在考查考生的识记能力和理解所学知识要点，把握知识间内在联系的能力；能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论．