A
本题考查文艺复兴运动的影响。由题干中的“从哥白尼到牛顿,自然科学的发展使上帝的立足之地日益缩小”可知,文艺复兴运动解放了人们的思想,推动近代科学诞生,从而挑战封建神学。故答案为A项。B项不是题干材料强调的重点;C、D两项无法从材料中得出。