解题思路：可遗传的变异有基因突变、基因重组和染色体变异；基因突变是生物变异的根本来源，基因突变和基因重组都能为进化提供原材料；同源染色体的非姐妹染色单体的交叉互换属于基因重组，只发生在减数分裂过程中，而非同源染色体之间的交换属于染色体结构变异可以在有丝分裂也可以在减数分裂．
A、“猫叫综合症”是人的第5号染色体部分缺失引起的，属于染色体结构异常，A正确；
B、基因突变能产生新基因，是生物变异的根本来源，B正确；
C、基因突变的结构形成等位基因，因此只改变基因的质不改变基因的量，能产生新的基因，进而产生新的基因型，C错误；
D、同源染色体的非姐妹染色单体的交叉互换属于基因重组，只发生在减数第一次分裂前期中，而非同源染色体之间的交换属于染色体结构变异可以在有丝分裂也可以在减数分裂，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 染色体结构变异的基本类型；基因突变的特征．
考点点评： 本题考查染色体结构的变异、基因突变和基因重组的相关知识，意在考查学生分析问题和解决问题的能力，属于中档题．