解题思路：生物圈内所有的植物、动物和微生物，它们所拥有的全部基因 以及各种各样的生态系统，共同构成了生物多样性．保护生物多样性的措施：就地保护，即建立自然保护区；迁地保护，如建立遗传资源种质库、植物基因库，以及野生动物园和植物园及水族馆等；制定必要的法规，对生物多样性造成重大损失的活动进行打击和控制．
A、野生大象一旦灭绝，生物多样性减少，人类将丧失部分宝贵的基因资源，故A正确；
B、根据题干信息“现有50%的非洲雄象不再长有长牙”，说明非洲象群中控制长牙的基因频率下降，故B正确；
C、就地保护是保护生物多样性最有效的措施，故C正确；
D、从1979年到1999年野生大象的种群数量急剧减少，主要是人为猎杀，不是自然选择，故D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 生物的多样性；自然选择学说的要点；生物多样性保护的意义和措施．
考点点评： 本题以非洲象为素材，考查生物多样性及其保护、种群的基因频率等相关知识，意在考查学生从材料中获取相关的生物学信息，并能运用这些信息，结合所学知识解决相关的生物学问题．