个人觉得是侧重点不同:
【主+谓+宾+现在分词宾补】的重点在于宾语本身,强调你见过Tom,他当时正在打球;
【主+谓+动名词的复合结构】的重点在于动名词所表示的动作,即你见过打球这件事,而打球的逻辑主语是Tom