A、生物的多样性包括基因的多样性、生物种类的多样性、生态系统的多样性，我国是世界上生物多样性最丰富的国家之一．不符合题意．
B、每个物种都是一个独特的基因库．生物种类的多样性是由基因的多样性决定的，所以其实质就是基因多样性．不符合题意．
C、生态系统是生物与环境构成的统一的整体，生态系统的多样性包括生物种类的多样性和生活环境的多样性，符合题意．
D、威胁生物生存的原因有栖息地被破坏、偷猎、外来物种入侵、环境污染、其他原因等．其中最主要的原因就是栖息地等生态环境的破坏以及偷猎．保护生物的栖息环境，保护生态系统是保护生物多样的根本措施．符合题意．
故选：CD