同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性（degeneracy）.对应于同一种氨基酸的不同密码子称为同义密码子（synonymous codon）,只有色氨酸与甲硫氨酸仅有1个密码子.
密码子简并性具有重要的生物学意义,它可以减少有害突变.若每种氨基酸只有一个密码子,61个密码子中只有20个是有意义的,各对应于一种氨基酸.剩下41个密码子都无氨基酸所对应,将导致肽链合成终止.由基因突变而引起肽链合成终止的概率也会大大增加.简并性使得那些即使密码子中碱基被改变,仍然能编码原来氨基酸的可能性大为提高.密码的简并也使DNA分子上碱基组成有较大余地的变动,例如细菌DNA中G+C含量变动很大,但不同G+C含量的细菌却可以编码出相同的多肽链.所以遗传密码的简并性在物种的稳定上起着重要的作用.
简并性（degeneracy）:密码子共有64个,除了3个终止密码子外,其余61个密码子代表20种氨基酸,除了Trp 和Met各有1 个密码子外,其它18种氨基酸均有2个或多个密码子,密码子中有一个核苷酸可以是不同的,这称为密码子的简并性.密码子的简并性不是随机的主要是由第三位的碱基摆动造成的,如脯氨酸的4 个同义密码子（CCU、CCC、CCA、CCG）,5’-端的2 个碱基相同,不同的是3’-端的碱基.5’端的2个碱基决定密码子的特异性.这是意味着第三位碱基摆动可以不影响正常的翻译.密码子简并性和它的特殊排列,对于防止突变的影响,保证种属稳定性有一定意义.