解题思路：A、根据质量守恒定律进行分析判断．
B、根据化合价规律进行分析判断．
C、根据相对分子质量为构成分子的各原子的相对原子质量之和，进行分析判断．
D、根据原子的构成进行分析判断．
A、由质量守恒定律，参加化学反应的物质的总质量等于反应后生成的物质的总质量，故选项说法正确．
B、化合物中元素化合价的正价总数与负价总数相等，故选项说法正确．
C、一氧化碳分子与氮气分子的相对分子质量分别为12+16=28、14×2=28，相等，故选项说法正确．
D、在原子中原子核内的质子数不一定都等于中子数，如氢原子中质子数为1，中子数为0，故选项说法错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 质量守恒定律及其应用；原子的定义与构成；化合价规律和原则；相对分子质量的概念及其计算．
考点点评： 本题难度不大，掌握质量守恒定律、有关化学式的计算、化合价的原则、化学变化的实质、分子的基本性质、原子的构成等即可正确解答本题．