好氧菌
亦称需氧菌、需氧微生物.在有氧环境中生长繁殖,氧化有机物或无机物的产能代谢过程,以分子氧为最终电子受体,进行有氧呼吸.包括大多数细菌、放线菌和真菌.进行有氧呼吸,但没有线粒体.如：链霉素、红霉素,弗兰克氏菌
微好氧菌
性质：仅能在较低氧分压下正常生活的微生物.正常大气的氧分压为0.2Pa,而微好氧菌仅生活在0.01～0.03Pa下.例如发酵单胞菌属和弯曲杆菌属等.
如：
醋杆菌属 嗜酸菌属 酸单胞菌属
热酸菌属 土壤单胞菌属 产碱菌属
交替单胞菌属 氨基杆菌属(胺杆菌属)
水螺菌属
氮单胞菌属 固氮根瘤菌属 固氮菌属
耐氧厌氧菌
代表菌种为溶组织梭菌.这类细菌不能利用氧,在无氧条件下生长好,而在有氧条件下生长不佳.
如：破伤风芽胞杆菌
专性厌氧菌 obligate anaerobe
是指在无氧的环境中才能生长繁殖的细菌.此类细菌缺乏完善的呼吸酶系统,只能进行无氧发酵,不但不能利用分子氧,而且游离氧对其还有毒性作用.如破伤风杆菌、肉毒杆菌、产生荚膜杆菌等.
只能在没有游离氧存在的环境中生存的微生物.甲烷菌即属此类细菌.人们利用甲烷菌等产生沼气,利用厌氧菌处理各种有机废物和废水.
兼性厌氧菌
又称兼嫌气性微生物,兼嫌气菌.在有氧或无氧环境中均能生长繁殖的微生物.在有氧（O2）或缺氧条件下,可通过不同的氧化方式获得能量.如酵母菌在有氧环境中进行有氧呼吸,在缺氧条件下发酵葡萄糖生成酒精.许多肠道细菌,如大肠杆菌等均属此类.
兼性厌氧菌 兼有需氧呼吸和无氧发酵两种功能,不论在有氧或无氧环境中都能生长,但以有氧时生长较好.大多数病原菌属于此.